我所杨帆团队构建人类指环病毒组资源库并解析其生态组织特征

2026年10月10日，我所杨帆团队在《Microbiome》在线发表了题为“Defining the Genomic and Ecological Landscapes of the Human Anellome”的研究论文。该研究整合我国6348份样本的宏基因组测序数据与全球公开基因组资源，构建了人类指环病毒数据库HANVdb及高分辨率分析框架，显著提升了亚洲人群指环病毒的基因组代表性，并系统解析了人类指环病毒组的多样性与生态组织特征。

指环病毒（Anellovirus）广泛而持久地存在于人体，是人类共生病毒组中遗传多样性最丰富的病毒类群。由于既往基因组资源存在地域分布不均、分类注释不一致和亚洲人群数据不足等问题，人类指环病毒组的整体多样性和群落结构长期缺乏系统认识。研究团队对全球公开指环病毒基因组进行了系统整理、重新注释和分类校正，并从我国血液、呼吸道和脑脊液等多队列样本中重建了3964条非冗余指环病毒基因组，使亚洲来源的人类指环病毒基因组数量由860条增至4824条。整合后的分类框架涵盖771个人类指环病毒物种层级单元，包括91个国际病毒分类委员会认可物种和680个潜在新物种，显著拓展了现有参考资源覆盖的病毒多样性。在此基础上，研究团队建立了包含10013个谱系的人类指环病毒组参考数据集和标准化分析流程。研究发现，个体可携带高度复杂的指环病毒群落，其中存在跨人群反复检出的核心指环病毒组；部分核心谱系与HIV感染者CD4 T细胞计数呈更明显的负相关，血浆与PBMC具有不同的指环病毒群落结构和谱系富集特征。此外，针对既往报道的一种特殊类型急性白血病相关的指环病毒（TTMV::RARA相关病毒），研究团队借助扩展后的全球基因组资源，解析了其进化关系，发现了特定的潜在基因调控特征及在血液细胞中的富集倾向，为进一步研究这类病毒与疾病的关联提供了线索。

图. 人类指环病毒的全球基因组分布与系统发育图谱以及中国多队列样本对其基因组多样性的拓展

我所博士研究生赵鹏、陈梦圆、康莹为论文共同第一作者，杨帆研究员、胡永峰副研究员为论文共同通讯作者。研究工作得到中国医学科学院医学与健康科技创新工程等项目资助。