王健伟、任丽丽团队联合解析健康人群呼吸道微生物组和抗生素抗性基因的传播风险

2025年5月6日，中国医学科学院病原生物学研究所王健伟、任丽丽团队联合国家生物信息中心李明锟团队合作在Microbiome上发表了“Transmission of the human respiratory microbiome and antibiotic resistance genes in healthy populations”的研究论文。研究深入解析了呼吸道微生物组在健康人群中的传播规律，以及抗生素耐药基因（ARGs）的传播风险，为呼吸道健康管理提供重要的科学数据。

人体微生物组可在个体间传播，影响感染性和非感染性疾病的易感性与严重程度，但呼吸道微生物组的传播机制尚缺乏系统研究。本研究通过对来自武汉市13个行政区的1046名健康城市居民的口咽拭子进行宏基因组分析，发现口咽微生物组具有明显的可传播性。首先，地理因素与口咽微生物组的差异关联性最高，同一城区内非共住个体的口咽微生物组相较于来自不同城区的非共住个体更为相似。共同居住者，尤其是配偶和兄弟姐妹之间，表现出更高的口咽菌株共享率，说明亲密接触是呼吸道菌群传递的重要因素。然而，与肠道菌群存在母婴传递现象不同，本研究并未在母婴之间发现呼吸道菌群垂直传播的证据。此外，研发发现口咽微生物组中存在多种抗生素抗性基因，其中15%与可移动遗传元件或质粒在基因组上存在关联，提示以上抗性基因可能在不同微生物之间发生水平转移。研究结果揭示了口咽微生物及抗性基因的传播特征，对理解呼吸道健康及公共卫生管理具有重要意义。

图. 共同居住者之间的口咽微生物传播

本研究得到了国家重点研发计划（2022YFA1304300）、中国医学科学院医学与健康科技创新工程项目（2020-I2M-2-013）、中国医学科学院中央级公益性科研院所基本科研业务费（2019PT310029）等项目的资助。