2024年1月19日，王健伟、郭斐研究团队在国际传染病权威杂志Emerg Infect Dis《新发传染病》在线发表题为“Residual Immunity from Smallpox Vaccination and Possible Protection from Mpox，China”的研究论文。作为天花疫苗，痘苗病毒天坛株（VTT）在中国消灭天花的卫生运动中发挥了重要作用。1980年世卫组织宣布根除天花后，国内停止了常规的天花疫苗接种。2022年9月中国报告了第一例猴痘输入性病例， 为系统评价中国人群体内的针对痘苗病毒的既存免疫力及对猴痘病毒的交叉保护作用，本研究采集了来自于北京、山西省、黑龙江省、湖北省以及深圳的1070例健康人外周血样本，进行针对VTT的抗体、记忆性B细胞和记忆性T细胞免疫学分析。在参与研究的人群中，478例出生于1930–1979年，592例出生于1980–2008年。研究发现，在1980年以前出生的人群中，28.7%的人检测到针对VTT的中和抗体，71.4%的人检测到记忆B细胞反应，65.7%的人检测到记忆T细胞反应。而1980后出生人群，几乎检测不到针对VTT 的抗体、记忆性B细胞和记忆性T细胞免疫反应。上述数据表明，1980年前出生的人群针对VTT的中和抗体水平在衰减，但大多数人仍存在针对VTT的记忆性B细胞和记忆性T细胞免疫反应，由于VTT与猴痘病毒存在较高的序列同源性，猴痘病毒再暴露或疫苗接种后，1980年前出生人群的免疫记忆可以迅速活化并产生保护性免疫反应，但1980年后出生的人群普遍缺乏针对猴痘病毒的免疫力。上述研究为猴痘疫苗的接种策略提供重要的数据支持

SARS-CoV-2的免疫持久性以及对突变株的交叉保护作用尚未完全阐明，自然感染人群为回答此科学问题提供了重要的平台。在2022年12月之前，我国采取动态清零的防控政策，使得研究个体的疫苗接种和感染情况均有明确记录，为相关研究提供了难得的独特样本。在前期研究基础上，2023年12月1日郭丽研究员等在《The Lancet Microbe》杂志在线发表了题为“Durability and cross-reactive immune memory to SARS-CoV-2 in individuals 2 years after recovery from COVID-19: a longitudinal cohort study” 的研究论文，进一步报道了新冠病毒自然感染的免疫特征。

2023年10月2日我所崔胜研究团队在Nature杂志在线发表了题为“Nucleic acid-triggered NADase activation of a short prokaryotic Argonaute”的论文。

2023年9月8日，我所吴志强团队在Nature Communications期刊上发表了题为“Panoramic analysis of coronaviruses carried by representative bat species in Southern China to better understand the coronavirus sphere”的研究论文。该研究对来自中国14个省的13064份蝙蝠样本进行了冠状病毒的筛查鉴定和系统性分析。

2023年6月27日，我所杨威研究团队在Journal of Virology杂志在线发表了题为“Broad Sarbecovirus Neutralizing Antibodies Obtained by Computational Design and Synthetic Library Screening”的研究论文。

2023年7月28日，我所钱朝晖团队和中国科学院生物物理研究所王祥喜团队合作在Cell Discovery期刊上发表了题为“Host susceptibility and structural and immunological insight of S proteins of two SARS-CoV-2 closely related bat coronaviruses”的研究论文，对2种2020

2023年7月6日，我所崔胜团队在Nature Communications杂志在线发表了题为“Identification of the SARS-unique domain of SARS-CoV-2 as an antiviral target”的研究论文。

2023年4月10日，郭丽研究员等在《Emerg Microbes Infect》杂志在线发表了题为“Omicron BA.1 breakthrough infections in inactivated COVID-19 vaccine recipients induced distinct pattern of antibody and T cell responses to different Omicron sublineages”的研究论文。